La flora de Baja California Sur se caracteriza por su riqueza y endemismo, con especies adaptadas a sus diversos climas áridos y semiáridos, incluyendo cactus, agaves y matorrales sarcocaules. El estado presenta tres ecosistemas principales: bosque de pino-encino, bosque tropical caducifolio y el dominante matorral sarcocaule, el cual es una variación del matorral xerófilo. La diversidad de plantas, con 820 especies endémicas de la Península, es vital para el sustento de la fauna local.
